Le Musée de Mértola nait du résultat de divers travaux archéologiques, de travaux de conservation et de recherche mis en œuvre par le Chantier Archéologique de Mértola.

En 1989, le centre de la maison romaine est ouvert au public afin de préserver les vestiges existants dans le sous-sol de la Mairie.

S’en suivit l'inauguration de la collection de pierres tombales préislamiques dans le donjon du château en 1991, la Basilique Paléochrétienne en 1993, la Chapelle et la Nécropole de S. Sébastien en 1999, l'Atelier de Tissage en 2000 et, en 2001, les centres d'Art Sacré, d'Art Islamique et la Forge du Forgeron.

Musée de Mértola :

NÚCLEO DA BASÍLICA PALEOCRISTÃ

NÚCLEO DA ACHADA DE SÃO SEBASTIÃO

NÚCLEO ROMANO

NÚCLEO ISLÂMICO

NÚCLEO DA ARTE SACRA

FORJA DO FERREIRO

NÚCLEO DE TECELAGEM

NÚCLEO DO CASTELO